Arktisen keskuksen laboratorio palvelee tällä hetkellä eniten maaperän hiilen kiertoon ja mikrobiologiaan, paleoekologiaan ja kasviyhdisteisiin liittyviä laboratorioanalyyseja, mutta laboratorio soveltuu laajasti erilaiseen ympäristö-ja biologisten materiaalien tutkimukseen. Laboratorioon kuuluva esikäsittelytila soveltuu monenlaisille näytteille, mukaan lukien siitepölynäytteet. Laboratoriossa on näytteiden jauhatukseen ja erotteluun sekä ravinne-ja mikrobiologisiin analyyseihin tarvittavia laitteita. Suuri osa laboratoriotiloista on yhteiskäytössä Lapin ammattikorkeakoulun kanssa.
Laboratorio toimii yhteistyöorganisaationa erilaisissa tutkimus-ja kehityshankkeissa, eikä varsinaisesti myy kaupallisia analyysipalveluja.